生化试剂
gibson 克隆
2024-12-20 08:36  浏览:20
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DNA Assembly Mix PLUS KIT产品货号:D0204P

储存条件:-20℃

产品组分:


组分/规格

10T

25T

50T

DNA Assembly Mix PLUS

50μl

125μl

250μl

pUC19 Control Plasmid, Linearized

(Ampr, 40 ng/μl)

5μl

5μl

5μl

500 bp Control Fragment (20 ng/μl)

5μl

5μl

5μl










DNA Assembly Mix PLUS产品简介:

基于重组原理的无缝克隆技术,作为新一代的克隆方法,不依赖繁琐的酶切、连接步骤,也不需要末端补平等操作,依据DNA片段与线性化载体末端的15~25nt同源序列的重组,可将插入片段克隆至任意线性载体的任意位点,载体自连背景极低,是一种简单、快速、高效的DNA定向克隆技术。

DNA Assembly MixPLUS无缝克隆试剂盒z快仅需5分钟即可完成单片段重组,且阳性率高于95%。Mix中添加的辅助因子,有效提高克隆阳性率;经优化的反应体系,能够一定程度上耐受未纯化PCR产物中含有的杂质。升级版的无缝克隆试剂盒具有更高的阳性率、更好的兼容性。


使用简单 —— 兼容PCR与酶切体系,省去繁琐的纯化步骤

超高效率 —— 可以稳定支持5-6片段在同一克隆体系

稳定可靠 —— 37℃放置一周或冻融30次,无明显下降


实验步骤:

1、实验流程概要

DNA Assembly Mix Plus

2、线性化克隆载体制备

选择合适的克隆位点,对载体进行线性化,载体的线性化可以通过酶切或反向 PCR 扩增完成。

① 酶切制备

推荐使用LabFD™快速内切酶进行双酶切,使载体线性化wan 全,以降低转化背景(假阳性克隆);若使用单酶切进行线性化,可以适当延长酶切时间以减少环状质粒残留。

注1:经双酶切进行线性化的载体无需去磷酸化,经单酶切则需要去磷酸化;

注2:酶切完成后,应将快速内切酶失活或对目的产物纯化后再用于重组反应。

② 反向 PCR 扩增制备

为减少扩增突变的引入,推荐使用高保真PCR Mix进行扩增。推荐使用预线性化质粒作为模板,以减少环状质粒模板残留对克隆阳性率的影响。

3、插入片段PCR引物设计

PCR引物的5' 端必须包含与其相邻片段(插入片段或载体)末端同源的15~25 nt(推荐18nt)序列。假如载体为粘性末端,且3'端突出,则引物设计必须包含突出部分;若5'端突出,则引物设计可以包含突出部分,也可以不包含。

插入片段正向扩增引物:

5'—上游载体末端同源序列+酶切位点(可选)+ 基因特异性正向扩增序列— 3'

插入片段反向扩增引物:

3'—基因特异性反向扩增序列+酶切位点(可选)+下游载体末端同源序列—5'

注1:尽量选择无重复序列且GC含量均匀的区域进行克隆,当载体克隆位点上下游25 nt区域内GC含量为40%~60%时,重组效率zui高;

DNA Assembly Mix Plus

注2:本试剂盒所提供的 pUC 19 载体(Ampr)连接端序列如下:

DNA Assembly Mix Plus 

4、插入片段的 PCR 扩增

推荐使用高保真PCR Mix进行扩增,以减少扩增突变的引入。建议使用纯化后的PCR产物进行无缝克隆反应,若PCR产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定为特异性扩增产物,可直接使用,但加样体积不应超过总反应体积的20%。

5、重组反应

①于冰水浴中配置以下反应体系:

组分

反应体系

阴性对照

阳性对照(如有必要)

DNA Assembly Mix

5μl

5μl

5μl

线性化载体(ng)

50~200ng

50~100ng

pUC19 Control Plasmid,Linearized, 1 μl

插入片段

10~200 ng

-

500 bp Control,

Fragment, 1 μl

ddH2O

To 10 μl


a.z适载体用量(ng)=0.02×载体碱基对数,即0.03pmol。

b.插入单片段,z适片段用量(ng)= 0.04×片段碱基对数;

插入多片段,每片段zui适用量(ng)= 0.02×片段碱基对数。

注1:若插入单片段的长度大于载体,则应互换载体与插入片段用量;

注2:若插入片段的长度小于200 bp,则插入片段应使用5倍载体用量;

注3:若按上述公式计算得到的用量超过zui低/zui高值,则建议直接按zui低/z高用量使用;

注4:载体片段过长、插入片段过长克隆阳性率均会降低。

重组反应体系配制完成后,用移液枪轻轻吸打混匀各组分,避免产生气泡,切勿涡旋。

② 将反应体系置于50℃,反应5~60min。

注1:推荐使用 PCR 仪等温控比较精准的仪器进行反应,反应时间不足或太长克隆效率均会降低;

注2:插入1-2个片段时,推荐反应时间5-15min,插入3-5个片段时,推荐反应时间15-30min;

注3:当载体骨架在 10 kb 以上或插入片段在4 kb以上时,建议延长反应时间到30-60min

注4:50℃反应完成后,建议进行瞬时离心,将反应液收集至管底。

③ 将反应液离心管置于冰上冷却,之后进行转化或者储存于-20℃。

注1:-20℃储存的重组产物,建议在1周内使用。

6、重组产物转化

取5~10μl反应液,加入到100 μl感受态细胞中缓慢吸打混匀,冰上放置30min。42℃热激45~60sec,冰浴5 min。加500 μl SOC或LB培养基,37℃振荡培养40~60min(200 rpm)。将菌液均匀涂布在含有对应抗生素的平板上,倒置于37℃过夜培养。

注1:不同感受态细胞z后的克隆阳性率会有所差别,推荐使用转化效率>108 CFU/μg的感受态细胞;

注2:菌落数取决于PCR产物与线性化载体的数量和纯度;

注3:阳性对照平板通常生长大量白色单菌落,阴性对照平板只生长很少的菌落。

7、阳性克隆检测

挑取单菌落至10 μl ddH2O中混匀,95℃裂解10 min 后,取1 μl裂解液作为模板,进行菌落PCR鉴定,或将单菌落接种至抗性培养基中培养过夜后,提取质粒进行酶切鉴定。

注1:菌落 PCR 时建议至少使用一条通用引物,避免假阳性结果;

注2:必要时可进一步对阳性结果进行测序鉴定。


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